Originarimente c'erano a Bova moltissime chiese. Alcune, anche monumentali, sono ancora ben conservate.

La più importante di queste è la Cattedrale, dedicata a Santa Maria Isodia. L'attuale cattedrale, ricostruita tra la fine del XVIII secolo e l'inizio del XX, sorge sulle rovine di quella più antica, risalente ai primi secoli dopo Cristo, ai piedi della Rocca del Castello. Ultimamente, gelosamente custodito dalle sue fondamenta, è stato scoperto un grande ossario, identificabile come tombe dei Vescovi.

All'interno della Cattedrale possiamo ammirare la statua in marmo della Madonna col Bambino, del 1584, attribuita a Rinaldo Bonanno.

Fra le altre importanti chiese ricordiamo la Chiesa di San Leo (XVIII sec.), che custodisce al suo interno la Statua del Santo, risalente al 1582 e contenente un reliquiario.

La Chiesa dello Spirito Santo, sconsacrata al culto cattolico, ma in cui si può assistere al suggestivo rito ortodosso, possiede un bel portale di ispirazione rinascimentale. All'interno è decorata con stucchi e marmi del XVIII secolo.

Altro bel portale è quello della Chiesa dell'Immacolata. Del sec. XVII è la Chiesa della Madonna del Carmine (Cappella Mesiani). Del XV la chiesa di S. Rocco, altro Santo patrono di Bova. La statua della Madonna della Visitazione, risalente al sec. XVIII, è attualmente conservata nella nuova chiesa di S. Caterina.